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選擇StepOnePlus™實時熒光定量PCR系統(tǒng)時,需要了解以下幾個關(guān)鍵參數(shù),以確保它能夠滿足您的實驗需求。這些參數(shù)可以分為兩大類:系統(tǒng)硬件性能參數(shù)和實驗應(yīng)用相關(guān)參數(shù)。
一、賽默飛StepOnePLus實時熒光定量PCR系統(tǒng)性能參數(shù)
1、檢測通道和濾光片
(1)關(guān)鍵點:StepOnePlus是四色通道系統(tǒng)。這意味著它可以同時檢測最多四種不同的熒光信號。
(2)檢測方法:如果您使用TaqMan探針(如FAM, VIC)或SYBR Green染料法,需要確認(rèn)染料/探針的熒光基團(tuán)是否與儀器的濾光片波長匹配。StepOnePlus的標(biāo)配通道通常能覆蓋FAM, SYBR Green, VIC/JOE, NED/TAMRA/Cy3, ROX™等常用熒光基團(tuán)。
(3)多重檢測能力:如果您需要在一個反應(yīng)孔里同時檢測多個靶基因(多重PCR),四通道的限制就很重要。例如,一個通道用于內(nèi)參基因,那么最多還能檢測三個目標(biāo)基因。
2、通量
(1)關(guān)鍵點:StepOnePlus采用96孔板標(biāo)準(zhǔn)格式。
(2)樣本數(shù)量:您一次實驗最多需要運行多少個樣本?包括標(biāo)準(zhǔn)品、待測樣本、陰性對照等。96孔板除去對照,通常一次運行可處理80-90個樣本。
(3)實驗規(guī)劃:如果您的樣本量經(jīng)常接近或超過96個,可能需要考慮更高通量的儀器(如Applied Biosystems 384孔或更高通量的系統(tǒng)),或者接受分批次運行,這會增加時間和試劑成本。
3、動態(tài)范圍
(1)關(guān)鍵點:指儀器能夠準(zhǔn)確定量從低濃度到高濃度模板的范圍,通常用數(shù)量級表示(例如,10個數(shù)量級)。
(2)需要了解:StepOnePlus具有很寬的動態(tài)范圍(通??蛇_(dá)10個數(shù)量級),這對于準(zhǔn)確量化拷貝數(shù)差異巨大的樣本(如病毒載量檢測、基因表達(dá)高低懸殊的樣本)至關(guān)重要。
4、靈敏度
(1)關(guān)鍵點:指儀器能夠檢測到的低模板拷貝數(shù)。
(2)需要了解:如果您的研究涉及痕量核酸的檢測(如微量病原體、低豐度基因表達(dá)、循環(huán)腫瘤DNA等),高靈敏度是首要考慮因素。StepOnePlus的靈敏度很高,通常可以檢測到單拷貝的模板。
二、賽默飛StepOnePlus實時熒光定量PCR實驗應(yīng)用相關(guān)參數(shù)
1、溫控系統(tǒng)和升溫速率
(1)關(guān)鍵點:StepOnePlus使用半導(dǎo)體帕爾貼技術(shù)進(jìn)行溫控。
(2)溫控精度和均一性:這直接影響PCR擴(kuò)增的效率性和特異性,確保所有反應(yīng)孔的條件一致,結(jié)果可靠。
(3)升溫速率:更快的升溫速率可以縮短實驗周期。StepOnePlus的速率屬于標(biāo)準(zhǔn)水平,適合絕大多數(shù)常規(guī)qPCR實驗。如果您對實驗速度有高要求,可以考慮更快速的機(jī)型。
2、軟件功能和分析能力
(1)關(guān)鍵點:配套的StepOne™ Software是操作儀器和分析數(shù)據(jù)的核心。
(2)用戶界面:是否易于上手,進(jìn)行程序設(shè)置、板面定義和運行監(jiān)控。
(3)數(shù)據(jù)導(dǎo)出:能否方便地將原始數(shù)據(jù)(Ct值等)導(dǎo)出到其他專業(yè)分析軟件(如Excel, GraphPad Prism)進(jìn)行進(jìn)一步處理。
3、兼容性
(1)關(guān)鍵點:儀器對耗材和試劑的兼容性。
(2)耗材:是否必須使用原廠的昂貴PCR板/蓋膜,還是兼容其他品牌的低成本耗材(需確認(rèn)光學(xué)兼容性)。
(3)試劑:系統(tǒng)是開放式的,可以使用任何品牌的qPCR試劑(TaqMan或SYBR Green),這給了您更大的選擇和成本控制空間。
三、總結(jié)選擇建議
StepOnePlus是一款非常成熟、穩(wěn)定且用戶友好的中端qPCR儀。它非常適合以下用戶:
1、進(jìn)行基因表達(dá)分析、病原體檢測、SNP分型等常規(guī)qPCR實驗的學(xué)術(shù)實驗室或臨床檢測實驗室。
2、樣本通量在96孔板范圍內(nèi)。
3、注重實驗結(jié)果的準(zhǔn)確性和重復(fù)性。
4、希望平衡儀器性能與長期使用成本。
在選擇前,能結(jié)合您的具體實驗需求,與供應(yīng)商的技術(shù)支持詳細(xì)溝通,甚至可以要求進(jìn)行樣本測試,以最直觀地驗證StepOnePlus是否滿足您的要求。